骨髓炎可以根据不同的标准加以分类，如：感染的病程、机制以及宿主对感染的反应类型。根据病程，骨髓炎可分为急性、亚急性或慢性三型，但是，划分这三型的时间界限有些武断。根据感染的机制，骨髓炎可分为外源性或血源性两类。外源性骨髓炎是由开放骨折、手术（医源性）或邻近组织感染漫延引起的；而血源性骨髓炎则来自菌血症。另外，骨髓炎还可依据宿主对感染的反应分为化脓性或非化脓性（肉芽肿性）两类。Cierny和Mader根据宿主反应和解剖标准提出一套慢性骨髓炎分类方法，这种分类方法在慢性骨髓炎的章节做进一步的阐述。我们倾向于使用依据病程的分类法（急性、亚急性和慢性）和依据病理机制的分类法（外源性或血源性）。
   骨髓炎易与其他的疾病混淆：
    (一)软组织深部脓肿 局部炎症明显，关节活动不受影响，全身中毒症状不明显。
    (二)蜂窝组织炎 局部表浅红肿，范围较广，关节和全身症状不明显。
    (三)风湿性关节炎 均为亚急性病变，两侧对称，各关节发病，有时为游走性，白细胞数不增高。
    (四)化脓性关节炎 表现部位在关节处而不在干骺端。关节肿胀，关节腔内早期可抽出渗液，细菌培养阳性；晚期为脓性渗出液，关节活动受限。
    (五)恶性肿瘤 尤其象尤文氏瘤，发病时高热，骨骼有破坏，骨皮质呈葱皮样骨膜反应，白细胞数也高。局部炎症不如化脓性骨髓炎明显，全身中毒症状不明显，关节活动好，痛剧，穿刺活检可明确诊断。